Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a1Q00780 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col8a1Q00780 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a1Q00780 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a1Q00780 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a1Q00780 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a1Q00780 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col8a1Q00780 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms