Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp4Q00724 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms