Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabpb1Q00420 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabpb1Q00420 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms