Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfdP97946 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VegfdP97946 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms