Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lama4P97927 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lama4P97927 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lama4P97927 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Lama4P97927 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama4P97927 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama4P97927 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama4P97927 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lama4P97927 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lama4P97927 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama4P97927 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama4P97927 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lama4P97927 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms