Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cry1P97784 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cry1P97784 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cry1P97784 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cry1P97784 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cry1P97784 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cry1P97784 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cry1P97784 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cry1P97784 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cry1P97784 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cry1P97784 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cry1P97784 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms