Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc1P97496 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc1P97496 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcc1P97496 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms