Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkaP97477 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkaP97477 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkaP97477 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkaP97477 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkaP97477 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkaP97477 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AurkaP97477 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkaP97477 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AurkaP97477 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms