Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frg1P97376 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg1P97376 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frg1P97376 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg1P97376 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frg1P97376 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Frg1P97376 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms