Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b3P97370 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b3P97370 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms