Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SmsP97355 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SmsP97355 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SmsP97355 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SmsP97355 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SmsP97355 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmsP97355 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmsP97355 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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SmsP97355 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmsP97355 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmsP97355 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmsP97355 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SmsP97355 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmsP97355 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmsP97355 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmsP97355 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SmsP97355 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmsP97355 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmsP97355 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmsP97355 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmsP97355 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmsP97355 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmsP97355 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmsP97355 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmsP97355 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SmsP97355 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmsP97355 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmsP97355 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmsP97355 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmsP97355 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmsP97355 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmsP97355 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SmsP97355 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmsP97355 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmsP97355 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmsP97355 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmsP97355 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmsP97355 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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SmsP97355 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmsP97355 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmsP97355 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmsP97355 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmsP97355 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmsP97355 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmsP97355 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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SmsP97355 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmsP97355 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmsP97355 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SmsP97355 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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SmsP97355 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SmsP97355 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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SmsP97355 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SmsP97355 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SmsP97355 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SmsP97355 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SmsP97355 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SmsP97355 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SmsP97355 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SmsP97355 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SmsP97355 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SmsP97355 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SmsP97355 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SmsP97355 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SmsP97355 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SmsP97355 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SmsP97355 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SmsP97355 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SmsP97355 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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