Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pkp1P97350 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp1P97350 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp1P97350 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp1P97350 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp1P97350 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pkp1P97350 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp1P97350 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pkp1P97350 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp1P97350 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp1P97350 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp1P97350 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp1P97350 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp1P97350 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp1P97350 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp1P97350 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp1P97350 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pkp1P97350 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp1P97350 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp1P97350 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp1P97350 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp1P97350 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp1P97350 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp1P97350 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp1P97350 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp1P97350 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp1P97350 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp1P97350 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp1P97350 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp1P97350 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp1P97350 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp1P97350 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp1P97350 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp1P97350 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp1P97350 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp1P97350 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp1P97350 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp1P97350 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pkp1P97350 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp1P97350 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms