Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arf1P84078 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arf1P84078 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arf1P84078 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arf1P84078 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf1P84078 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf1P84078 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms