Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg1P83887 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms