Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NyxP83503 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NyxP83503 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NyxP83503 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NyxP83503 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NyxP83503 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NyxP83503 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NyxP83503 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NyxP83503 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NyxP83503 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NyxP83503 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NyxP83503 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NyxP83503 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NyxP83503 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NyxP83503 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NyxP83503 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NyxP83503 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NyxP83503 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NyxP83503 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NyxP83503 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NyxP83503 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NyxP83503 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NyxP83503 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NyxP83503 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NyxP83503 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NyxP83503 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NyxP83503 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NyxP83503 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NyxP83503 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NyxP83503 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NyxP83503 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NyxP83503 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NyxP83503 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NyxP83503 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NyxP83503 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NyxP83503 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NyxP83503 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NyxP83503 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NyxP83503 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NyxP83503 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NyxP83503 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NyxP83503 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NyxP83503 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NyxP83503 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NyxP83503 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NyxP83503 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NyxP83503 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms