Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfi1P70338 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1P70338 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms