Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Cux2P70298 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cux2P70298 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cux2P70298 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cux2P70298 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cux2P70298 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cux2P70298 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cux2P70298 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cux2P70298 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux2P70298 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cux2P70298 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Cux2P70298 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms