Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf5P70191 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Traf5P70191 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf5P70191 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf5P70191 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf5P70191 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf5P70191 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf5P70191 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf5P70191 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf5P70191 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf5P70191 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf5P70191 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf5P70191 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms