Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SbdsP70122 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SbdsP70122 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SbdsP70122 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SbdsP70122 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SbdsP70122 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SbdsP70122 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SbdsP70122 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbdsP70122 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbdsP70122 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbdsP70122 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbdsP70122 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SbdsP70122 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms