Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SnrpnP63163 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpnP63163 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpnP63163 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpnP63163 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpnP63163 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpnP63163 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpnP63163 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpnP63163 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpnP63163 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpnP63163 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpnP63163 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpnP63163 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpnP63163 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpnP63163 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpnP63163 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms