Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Barhl1P63157 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Barhl1P63157 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms