Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbdP63072 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbdP63072 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UbdP63072 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UbdP63072 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UbdP63072 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UbdP63072 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UbdP63072 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UbdP63072 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbdP63072 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UbdP63072 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbdP63072 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbdP63072 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UbdP63072 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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