Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms