Protein–RNA interactions for Protein: P62852

Rps25, 40S ribosomal protein S25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps25P62852 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps25P62852 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps25P62852 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms