Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl23aP62751 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl23aP62751 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms