Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm5P62322 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms