Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rps18P62270 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps18P62270 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms