Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrch1P62046 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrch1P62046 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms