Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ufm1P61961 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufm1P61961 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms