Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Depdc5P61460 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Depdc5P61460 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Depdc5P61460 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms