Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf13P61216 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf13P61216 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf13P61216 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms