Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem258P61166 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms