Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms