Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Csrnp3P59055 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csrnp3P59055 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms