Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tm6sf1P58749 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tm6sf1P58749 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms