Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd4P58467 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd4P58467 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd4P58467 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd4P58467 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd4P58467 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Setd4P58467 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Setd4P58467 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd4P58467 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd4P58467 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd4P58467 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd4P58467 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd4P58467 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd4P58467 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms