Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dpf3P58269 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dpf3P58269 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms