Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpa1P57784 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpa1P57784 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpa1P57784 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms