Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samsn1P57725 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samsn1P57725 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms