Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bace1P56818 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bace1P56818 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace1P56818 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace1P56818 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace1P56818 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bace1P56818 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Bace1P56818 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bace1P56818 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bace1P56818 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bace1P56818 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms