Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd5P56812 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd5P56812 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms