Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf5P56477 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf5P56477 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf5P56477 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf5P56477 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf5P56477 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf5P56477 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Irf5P56477 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf5P56477 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf5P56477 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf5P56477 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf5P56477 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf5P56477 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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