Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp1P56183 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp1P56183 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms