Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtskP55097 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtskP55097 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtskP55097 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtskP55097 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtskP55097 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtskP55097 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtskP55097 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtskP55097 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtskP55097 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtskP55097 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtskP55097 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtskP55097 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtskP55097 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CtskP55097 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtskP55097 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtskP55097 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtskP55097 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtskP55097 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtskP55097 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtskP55097 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtskP55097 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtskP55097 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtskP55097 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtskP55097 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtskP55097 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtskP55097 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtskP55097 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtskP55097 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms