Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad23bP54728 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms