Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PitpnbP53811 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PitpnbP53811 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms