Protein–RNA interactions for Protein: P53776

Lhx4, LIM/homeobox protein Lhx4, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx4P53776 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx4P53776 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx4P53776 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms