Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp1P52624 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp1P52624 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp1P52624 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp1P52624 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms