Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr1cP52432 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr1cP52432 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms