Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XpcP51612 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XpcP51612 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XpcP51612 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XpcP51612 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XpcP51612 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XpcP51612 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XpcP51612 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XpcP51612 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XpcP51612 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XpcP51612 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XpcP51612 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XpcP51612 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XpcP51612 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
XpcP51612 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XpcP51612 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XpcP51612 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XpcP51612 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XpcP51612 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XpcP51612 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XpcP51612 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XpcP51612 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XpcP51612 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XpcP51612 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XpcP51612 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XpcP51612 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XpcP51612 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XpcP51612 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XpcP51612 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XpcP51612 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XpcP51612 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XpcP51612 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XpcP51612 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XpcP51612 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XpcP51612 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XpcP51612 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XpcP51612 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XpcP51612 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
XpcP51612 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XpcP51612 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XpcP51612 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XpcP51612 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XpcP51612 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XpcP51612 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XpcP51612 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XpcP51612 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XpcP51612 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XpcP51612 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XpcP51612 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XpcP51612 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XpcP51612 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XpcP51612 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XpcP51612 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XpcP51612 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XpcP51612 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XpcP51612 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XpcP51612 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XpcP51612 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XpcP51612 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XpcP51612 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XpcP51612 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XpcP51612 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XpcP51612 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
XpcP51612 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XpcP51612 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XpcP51612 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XpcP51612 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XpcP51612 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XpcP51612 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XpcP51612 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XpcP51612 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XpcP51612 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XpcP51612 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XpcP51612 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XpcP51612 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XpcP51612 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XpcP51612 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XpcP51612 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XpcP51612 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XpcP51612 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XpcP51612 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms